Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms