Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8JA6NMD2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8JA6NMD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms