Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POTEMA6NI47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEMA6NI47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEMA6NI47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms