Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF860A6NHJ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms