Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC13A5PLN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms