Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF22A3QJZ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms