Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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