Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP13Q92995 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP13Q92995 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP13Q92995 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP13Q92995 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP13Q92995 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP13Q92995 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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USP13Q92995 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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USP13Q92995 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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USP13Q92995 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP13Q92995 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
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