Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF397Q8NF99 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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