Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NBR1Q14596 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NBR1Q14596 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NBR1Q14596 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NBR1Q14596 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NBR1Q14596 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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NBR1Q14596 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NBR1Q14596 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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