Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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