Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms