Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRSF2Q01130 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms