Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms