Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
IFI27P40305 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
IFI27P40305 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
IFI27P40305 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
IFI27P40305 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
IFI27P40305 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
IFI27P40305 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms