Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms