Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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CD247P20963 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD247P20963 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD247P20963 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD247P20963 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD247P20963 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD247P20963 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD247P20963 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CD247P20963 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CD247P20963 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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