Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms