Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms