Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TPRKBQ9Y3C4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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