Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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