Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms