Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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