Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms