Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms