Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FAM78BQ5VT40 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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FAM78BQ5VT40 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FAM78BQ5VT40 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FAM78BQ5VT40 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FAM78BQ5VT40 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FAM78BQ5VT40 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FAM78BQ5VT40 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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