Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms