Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKDCCQ504Y2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms