Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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