Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC27Q2M243 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC27Q2M243 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms