Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGNL1Q0VF96 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CGNL1Q0VF96 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms