Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms