Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms