Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CKBP12277 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKBP12277 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKBP12277 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms