Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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