Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLIP2Q9UDT6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms