Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms