Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGAP1Q96PV0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGAP1Q96PV0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGAP1Q96PV0 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms