Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL5Q6EMB2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms