Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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