Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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