Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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