Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms