Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms