Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RALAP11233 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RALAP11233 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms