Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms