Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4BQ8N7F7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms