Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms