Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PDLIM3Q53GG5 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PDLIM3Q53GG5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PDLIM3Q53GG5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDLIM3Q53GG5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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