Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PMCHL1Q16048 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms